台胞证遗失
一、先至遗失地派出所申报台胞证遗失，取得报案证明
二、携带报案证明和护照或身份证等，可以证明身份的证件以及照片去当地市公安局出入境管理处签证处办理签证，会先补发一次性的台胞证，据此持以离境，使用该临时证件出关，剩下的原台胞证遗失重发等工作，等回台之后再找旅行社办理，作业时间大约二到四天，一般省、市公安局都有签证处可以办理，如果在内地的小地方遗失，需到大城市办理。

护照遗失
联络最近的香港或是澳门的台湾机构，像香港是台北经济文化办事处（原中华旅行社），澳门也有一间台湾的经济文化办事处，实质上是台湾的官方机构，有权责处理这类事件：
一、先取得报案证明
二、然后连同护照或身分证、健保卡等可以证明身份的证件复印件，传真到台北经济文化办事处等台湾官方机构，他们会先跟台湾方面，证明你的身份后，发公文或是以亲自带领的方式，要求香港或澳门海关允许通关，让你得以入境香港或澳门，并进入机场登机返台，这也需要一至数天的工作时间，而且假日一样是休息的。(办理程序详见：http://www.taiwaninfo.org/passport.htm)

护照跟台胞证都遗失
护照的解决方式还是跟上面一样，至于台胞证因已经无法提供护照，所以还是得用护照复印件或身份证证明身份，然后按前述两项流程补办，建议出国时，要准备护照等证件复印件，一份随身携带，一份放在家里，万一不幸遗失旅行证件，这些资料可以用最快的速度证明身分，并办理补发，不至延误预定行程，如果并未在大陆地区设有户籍或领用大陆地区护照，首先您应先至大陆公安部门申报遗失，并取得报案证明，同时办理临时台胞证，经由香港罗湖管制站，亲赴台北经济文化办事处（原中华旅行社）申请遗失补发护照或入国证明书返国。此外，若遗失护照的国民需经澳门返台，可先将大陆公安之报案证明、身分证明文件及台胞证复印件先电传到在澳门的澳门事务处服务组(台北经济文化中心)，他们会先通知澳门政府当事人的入境资料，当事人可择期进入澳门后，再向台北经济文化中心申办入国证明书返台。
办理程序同上

另：关于是否可以搭直航班机，不经香港直接回台湾补办护照的问题
打电话问长荣或华航(台湾的航空公司才能帮你办),但航空公司会跟你说他们无法确定你是否何时可以搭机，因为他们要等台湾海关确定你的身份后才会让你上飞机
一般来讲，若是六个月内出国且身上带有身分证正本或台湾驾照正本或健保IC卡等相关有片及身份证字号之证件者，可以由大陆地区搭机经香港转搭华航或长荣班机返台。
1.大陆办登机手续时提供临时台胞证及报案证明，大陆航段航空公司会让您登机到香港。
2.到达香港，到转机柜台办理登机手续时提供：1.报案证明 2.身份证件。柜台人员会上电报回台湾机场航空公司柜台，要求与中正机场入出境管理局确认入国许可，若入国许可没问题，则会准许搭机。
3.到达台北后，在过海关前有入出境管理局柜台，持身份证件正本办理临时入国许可证即可。
备注：假使身上未带身份证等证件，可请家人送至机场，再请机场航空公司柜台人员送交。

相关办事机构

台北经济文化办事处（原香港中华旅行社）
地 址：香港金钟道89号力宝中心第一座40楼（位於金鐘地鐵站B出口）
服務時間：週一至週五上午九時至下午一時
电 话：00852-2530-1187

台北经济文化办事处（澳门）
地 址：澳门新口岸宋玉生广场411-417号皇朝广场6楼F-K座
电 话：(002-853) 306282，306289

以上資料來源自深圳台商協會