根據：大陸地區配偶申請在臺灣地區定居送件須知 0604應備文件的第六條

Quote（六）喪失原籍證明之公證書。（如一時無法補具者，得填寫具結書，俟定居後三個月內再補具）。

所以那個三個月應該是定居后三個月内補上，就是你去戶政事務所辦理戶籍手續那天開始算，當然如果確實有特殊情況，你和移民署聯係溝通好后，時間上大概可以稍微寬限幾日的。
除籍要幾天，這就不好說了，快的話可能很快，反正主要就是跑2個地方，出入境及派出所，如果他們刁難你，那一個地方可能都讓你跑好幾天，然後讓你兩邊來回跑也辦不好，之後可能不同人有不同的需求，比方去改銀行的賬戶，房產的信息更正之類的，所以沒個準吧。